Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SUSD3Q96L08 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SUSD3Q96L08 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SUSD3Q96L08 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SUSD3Q96L08 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SUSD3Q96L08 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SUSD3Q96L08 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SUSD3Q96L08 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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