Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRIQ1Q96JM4 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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