Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms