Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TROQ12816 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TROQ12816 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TROQ12816 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TROQ12816 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TROQ12816 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TROQ12816 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TROQ12816 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TROQ12816 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TROQ12816 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TROQ12816 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TROQ12816 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TROQ12816 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TROQ12816 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TROQ12816 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TROQ12816 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TROQ12816 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TROQ12816 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TROQ12816 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TROQ12816 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TROQ12816 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TROQ12816 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TROQ12816 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TROQ12816 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TROQ12816 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TROQ12816 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TROQ12816 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TROQ12816 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TROQ12816 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TROQ12816 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TROQ12816 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TROQ12816 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TROQ12816 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TROQ12816 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TROQ12816 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TROQ12816 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TROQ12816 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TROQ12816 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TROQ12816 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TROQ12816 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TROQ12816 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TROQ12816 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TROQ12816 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TROQ12816 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TROQ12816 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TROQ12816 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TROQ12816 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TROQ12816 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TROQ12816 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TROQ12816 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TROQ12816 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TROQ12816 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TROQ12816 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TROQ12816 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TROQ12816 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TROQ12816 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TROQ12816 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TROQ12816 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TROQ12816 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TROQ12816 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TROQ12816 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TROQ12816 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TROQ12816 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TROQ12816 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TROQ12816 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TROQ12816 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TROQ12816 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TROQ12816 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TROQ12816 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TROQ12816 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TROQ12816 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TROQ12816 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TROQ12816 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TROQ12816 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TROQ12816 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TROQ12816 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TROQ12816 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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