Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms