Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPC3P51654 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC3P51654 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC3P51654 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC3P51654 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC3P51654 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC3P51654 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC3P51654 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC3P51654 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC3P51654 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC3P51654 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC3P51654 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC3P51654 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC3P51654 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC3P51654 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC3P51654 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC3P51654 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC3P51654 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC3P51654 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC3P51654 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC3P51654 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC3P51654 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPC3P51654 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms