Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms