Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PSMA1P25786 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms