Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 328.1 ms