Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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GGTLC3B5MD39 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GGTLC3B5MD39 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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