Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 RAB43-205ENST00000393308 4193 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 TAF5L-204ENST00000366676 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPOQ9BU64 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms