Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms