Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms