Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms