Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR1

ETFRF1, Electron transfer flavoprotein regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFRF1Q6IPR1 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ETFRF1Q6IPR1 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms