Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG7O95352 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG7O95352 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms