Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms