Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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