Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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