Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKOR2Q2VWA4 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms