Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms