Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 SPRTN-202ENST00000295050 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 BRD1-202ENST00000404034 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ZMIZ2-215ENST00000615423 2772 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 CABIN1-204ENST00000405822 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 DIS3-205ENST00000545453 3651 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 SMCR5-201ENST00000543475 2844 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 SPATA13-202ENST00000382095 6665 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 MVP-201ENST00000357402 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 LEPROT-201ENST00000371065 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ZSCAN20-202ENST00000373413 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 KDM5D-202ENST00000382806 5134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 TMEM25-208ENST00000524725 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AC091078.1-202ENST00000543286 2012 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 SMIM5-202ENST00000537494 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 PCDHGA4-202ENST00000612927 2691 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 LGALS3BP-201ENST00000262776 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 LAMB1-203ENST00000393560 2806 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 TLK1-205ENST00000431350 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AP2A1-201ENST00000354293 3388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 GOLGA4-201ENST00000356847 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 MGLL-205ENST00000453507 4552 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 LRRC32-203ENST00000407242 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 SLC2A1-203ENST00000426263 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 OVOL1-201ENST00000335987 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 NUF2-201ENST00000271452 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 BOC-215ENST00000495514 4646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 SLC25A25-AS1-201ENST00000418747 6391 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 CPT1C-203ENST00000392518 2910 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ETV5-201ENST00000306376 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 PARP15-205ENST00000483793 4439 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 RAB11FIP3-205ENST00000450428 3203 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 IKBKE-203ENST00000581977 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 SEMA6D-204ENST00000358066 5913 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 FP325332.1-201ENST00000624818 2045 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 LMX1A-202ENST00000342310 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 SIN3A-208ENST00000567289 4078 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AQP7-205ENST00000379507 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 MST1R-215ENST00000621387 4449 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 CEP89-201ENST00000305768 5678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 LINC00894-206ENST00000450989 2361 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 UBOX5-201ENST00000217173 4631 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 SLC5A6-201ENST00000310574 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 RGS3-204ENST00000350696 4387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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