Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms