Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 BCORL1-205ENST00000540052 7127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 PCDHGA8-202ENST00000610569 6480 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PLNP26678 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 PLCXD1-201ENST00000381657 5507 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 ACSS3-203ENST00000548058 9254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 FBXW8-202ENST00000455858 4648 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PLNP26678 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms