Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EDN1P05305 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EDN1P05305 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EDN1P05305 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EDN1P05305 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EDN1P05305 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EDN1P05305 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EDN1P05305 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EDN1P05305 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDN1P05305 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDN1P05305 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDN1P05305 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDN1P05305 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDN1P05305 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDN1P05305 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDN1P05305 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDN1P05305 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDN1P05305 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDN1P05305 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms