Protein–RNA interactions for Protein: E5RGE8

Neuron-specific protein family member 2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E5RGE8 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E5RGE8 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
E5RGE8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
E5RGE8 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
E5RGE8 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E5RGE8 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E5RGE8 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
E5RGE8 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E5RGE8 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
E5RGE8 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E5RGE8 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E5RGE8 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
E5RGE8 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E5RGE8 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
E5RGE8 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E5RGE8 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E5RGE8 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
E5RGE8 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
E5RGE8 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
E5RGE8 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E5RGE8 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E5RGE8 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E5RGE8 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E5RGE8 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E5RGE8 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E5RGE8 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E5RGE8 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E5RGE8 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E5RGE8 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E5RGE8 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E5RGE8 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E5RGE8 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E5RGE8 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E5RGE8 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E5RGE8 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E5RGE8 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E5RGE8 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E5RGE8 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E5RGE8 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E5RGE8 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E5RGE8 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E5RGE8 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E5RGE8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E5RGE8 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E5RGE8 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E5RGE8 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms