Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVV-2B6SEH9 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.1 ms