Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms