Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y664

KPTN, KICSTOR complex protein kaptin, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPTNQ9Y664 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KPTNQ9Y664 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KPTNQ9Y664 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms