Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRELID3BQ9Y3B1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms