Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
DDX18Q9NVP1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms