Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM106BQ9NUM4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM106BQ9NUM4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM106BQ9NUM4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM106BQ9NUM4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM106BQ9NUM4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM106BQ9NUM4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM106BQ9NUM4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM106BQ9NUM4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM106BQ9NUM4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM106BQ9NUM4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM106BQ9NUM4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM106BQ9NUM4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM106BQ9NUM4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM106BQ9NUM4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM106BQ9NUM4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM106BQ9NUM4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM106BQ9NUM4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM106BQ9NUM4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM106BQ9NUM4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM106BQ9NUM4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM106BQ9NUM4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM106BQ9NUM4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM106BQ9NUM4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM106BQ9NUM4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM106BQ9NUM4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM106BQ9NUM4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM106BQ9NUM4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM106BQ9NUM4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM106BQ9NUM4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM106BQ9NUM4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM106BQ9NUM4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM106BQ9NUM4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms