Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 PPARA-206ENST00000440343 368 ntTSL 1 (best)42.8■■■■■ 4.442e-10■■■■■ 30.8
DROSHAQ9NRR4 PPARA-207ENST00000460086 433 ntTSL 1 (best)36.04■■■■□ 3.362e-10■■■■■ 30.8
DROSHAQ9NRR4 FAM160B2-211ENST00000498344 917 ntTSL 232.95■■■□□ 2.862e-10■■■■■ 30.8
DROSHAQ9NRR4 FAM160B2-202ENST00000427751 932 ntTSL 532.51■■■□□ 2.792e-10■■■■■ 30.8
DROSHAQ9NRR4 FAM160B2-208ENST00000488968 2702 ntTSL 225.71■■□□□ 1.712e-10■■■■■ 30.8
DROSHAQ9NRR4 PPARA-204ENST00000415785 531 ntTSL 424.8■■□□□ 1.562e-10■■■■■ 30.8
DROSHAQ9NRR4 PPARA-205ENST00000420804 572 ntTSL 222.76■■□□□ 1.232e-10■■■■■ 30.8
DROSHAQ9NRR4 SNX29-204ENST00000564791 1633 ntTSL 1 (best)17.05■□□□□ 0.322e-10■■■■■ 30.8
DROSHAQ9NRR4 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.032e-10■■■■■ 30.8
DROSHAQ9NRR4 SNX29-205ENST00000566228 8171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.582e-10■■■■■ 30.8
DROSHAQ9NRR4 PPARA-201ENST00000262735 9965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.742e-10■■■■■ 30.8
DROSHAQ9NRR4 CYHR1-207ENST00000528558 907 ntTSL 234.86■■■■□ 3.176e-7■■■■■ 30.8
DROSHAQ9NRR4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.918e-7■■■■■ 30.7
DROSHAQ9NRR4 SH3YL1-216ENST00000471948 2119 ntTSL 232.36■■■□□ 2.778e-7■■■■■ 30.7
DROSHAQ9NRR4 SH3YL1-213ENST00000463865 1999 ntTSL 528.75■■■□□ 2.198e-7■■■■■ 30.7
DROSHAQ9NRR4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.558e-7■■■■■ 30.7
DROSHAQ9NRR4 SH3YL1-226ENST00000497051 533 ntTSL 520.24■□□□□ 0.838e-7■■■■■ 30.7
DROSHAQ9NRR4 SH3YL1-209ENST00000451005 782 ntTSL 518.9■□□□□ 0.628e-7■■■■■ 30.7
DROSHAQ9NRR4 SH3YL1-208ENST00000431160 721 ntTSL 216.08■□□□□ 0.168e-7■■■■■ 30.7
DROSHAQ9NRR4 SH3YL1-205ENST00000403712 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.178e-7■■■■■ 30.7
DROSHAQ9NRR4 SH3YL1-222ENST00000479739 2236 ntTSL 212.95□□□□□ -0.348e-7■■■■■ 30.7
DROSHAQ9NRR4 SH3YL1-219ENST00000473104 2463 ntTSL 1 (best)12.8□□□□□ -0.368e-7■■■■■ 30.7
DROSHAQ9NRR4 SH3YL1-229ENST00000626873 1973 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.48e-7■■■■■ 30.7
DROSHAQ9NRR4 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.118e-7■■■■■ 30.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf159-214ENST00000473600 793 ntTSL 325.46■■□□□ 1.679e-7■■■■■ 30.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf159-211ENST00000465822 1933 ntTSL 223.79■■□□□ 1.49e-7■■■■■ 30.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.299e-7■■■■■ 30.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.069e-7■■■■■ 30.7
DROSHAQ9NRR4 PGK1-204ENST00000477335 353 ntTSL 314.21□□□□□ -0.144e-13■■■■■ 30.7
DROSHAQ9NRR4 PGK1-201ENST00000373316 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.174e-13■■■■■ 30.7
DROSHAQ9NRR4 PGK1-205ENST00000491291 702 ntTSL 513.67□□□□□ -0.224e-13■■■■■ 30.7
DROSHAQ9NRR4 NOTUM-203ENST00000477214 813 ntTSL 536.91■■■■□ 3.56e-9■■■■■ 30.6
DROSHAQ9NRR4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.676e-9■■■■■ 30.6
DROSHAQ9NRR4 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 13e-6■■■■■ 30.5
DROSHAQ9NRR4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.973e-6■■■■■ 30.5
DROSHAQ9NRR4 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.773e-6■■■■■ 30.5
DROSHAQ9NRR4 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.115e-6■■■■■ 30.5
DROSHAQ9NRR4 SEMA4B-206ENST00000558895 533 ntTSL 437.63■■■■□ 3.615e-6■■■■■ 30.5
DROSHAQ9NRR4 SEMA4B-218ENST00000561085 582 ntTSL 435.27■■■■□ 3.245e-6■■■■■ 30.5
DROSHAQ9NRR4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.195e-6■■■■■ 30.5
DROSHAQ9NRR4 SEMA4B-212ENST00000559792 585 ntTSL 433.98■■■■□ 3.035e-6■■■■■ 30.5
DROSHAQ9NRR4 SEMA4B-211ENST00000559322 559 ntTSL 431.37■■■□□ 2.615e-6■■■■■ 30.5
DROSHAQ9NRR4 TNFAIP2-203ENST00000559195 572 ntTSL 529.77■■■□□ 2.365e-6■■■■■ 30.5
DROSHAQ9NRR4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.312e-6■■■■■ 30.5
DROSHAQ9NRR4 SEMA4B-210ENST00000559300 541 ntTSL 427.87■■■□□ 2.055e-6■■■■■ 30.5
DROSHAQ9NRR4 SEMA4B-203ENST00000558051 552 ntTSL 425.81■■□□□ 1.725e-6■■■■■ 30.5
DROSHAQ9NRR4 SEMA4B-215ENST00000560089 2804 ntTSL 1 (best)25.27■■□□□ 1.645e-6■■■■■ 30.5
DROSHAQ9NRR4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.535e-6■■■■■ 30.5
DROSHAQ9NRR4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.435e-6■■■■■ 30.5
DROSHAQ9NRR4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.985e-6■■■■■ 30.5
DROSHAQ9NRR4 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.635e-6■■■■■ 30.5
DROSHAQ9NRR4 TMEM91-214ENST00000604123 757 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 30.5
DROSHAQ9NRR4 AFAP1-AS1-201ENST00000608442 6795 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.845e-6■■■■■ 30.5
DROSHAQ9NRR4 HSPG2-212ENST00000493940 584 ntTSL 519.48■□□□□ 0.719e-9■■■■■ 30.5
DROSHAQ9NRR4 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.919e-9■■■■■ 30.5
DROSHAQ9NRR4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.055e-7■■■■■ 30.4
DROSHAQ9NRR4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.855e-7■■■■■ 30.4
DROSHAQ9NRR4 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.174e-8■■■■■ 30.4
DROSHAQ9NRR4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.56e-8■■■■■ 30.4
DROSHAQ9NRR4 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.966e-8■■■■■ 30.4
DROSHAQ9NRR4 C7orf50-206ENST00000465681 2621 ntTSL 1 (best)23.35■■□□□ 1.331e-6■■■■■ 30.4
DROSHAQ9NRR4 IQSEC1-202ENST00000473088 545 ntTSL 426.58■■□□□ 1.856e-8■■■■■ 30.3
DROSHAQ9NRR4 ZC3H3-201ENST00000262577 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 30.3
DROSHAQ9NRR4 LRCH4-210ENST00000498539 819 ntTSL 324.9■■□□□ 1.583e-44■■■■■ 30.3
DROSHAQ9NRR4 VMP1-216ENST00000592790 4325 nt4.76□□□□□ -1.656e-16■■■■■ 30.3
DROSHAQ9NRR4 C16orf52-201ENST00000331057 1359 ntTSL 1 (best)43.95■■■■■ 4.634e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 GRN-215ENST00000589536 546 ntTSL 338.07■■■■□ 3.694e-11■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.634e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 FAM208B-205ENST00000473789 506 ntTSL 537.4■■■■□ 3.584e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.464e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 FAM208B-210ENST00000496681 522 ntTSL 336.47■■■■□ 3.434e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.364e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.224e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.114e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 ANKHD1-220ENST00000511151 1216 ntTSL 333.43■■■□□ 2.944e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.894e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.774e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 GRN-221ENST00000593167 763 ntTSL 532.35■■■□□ 2.774e-11■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.754e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.734e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.674e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.544e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.524e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 CCT7-204ENST00000409924 567 ntTSL 330.76■■■□□ 2.514e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 CCT7-211ENST00000480489 527 ntTSL 230.76■■■□□ 2.514e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 SCAMP3-209ENST00000497470 845 ntTSL 530.37■■■□□ 2.454e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.414e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.384e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 CCT7-203ENST00000399032 593 ntTSL 429.9■■■□□ 2.384e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.374e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 THRB-210ENST00000447414 575 ntTSL 429.71■■■□□ 2.354e-11■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 FAM208B-207ENST00000480839 540 ntTSL 329.68■■■□□ 2.344e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 GRHPR-207ENST00000491488 602 ntTSL 529.52■■■□□ 2.324e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 C5orf66-201ENST00000505828 561 ntTSL 429.2■■■□□ 2.264e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.224e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.124e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 SCAMP3-204ENST00000465312 715 ntTSL 528.11■■■□□ 2.094e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 UBXN6-207ENST00000591919 1613 ntTSL 528.02■■■□□ 2.084e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 THRB-204ENST00000413780 896 ntTSL 327.62■■■□□ 2.014e-11■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.934e-6■■■■■ 30.2
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