Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIT2Q9NQR4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIT2Q9NQR4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIT2Q9NQR4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIT2Q9NQR4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIT2Q9NQR4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIT2Q9NQR4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIT2Q9NQR4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIT2Q9NQR4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NIT2Q9NQR4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIT2Q9NQR4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIT2Q9NQR4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIT2Q9NQR4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIT2Q9NQR4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIT2Q9NQR4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIT2Q9NQR4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIT2Q9NQR4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIT2Q9NQR4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms