Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC113Q9H0I3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms