Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRRX2Q99811 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRRX2Q99811 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms