Protein–RNA interactions for Protein: Q96E52

OMA1, Metalloendopeptidase OMA1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OMA1Q96E52 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OMA1Q96E52 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OMA1Q96E52 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OMA1Q96E52 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OMA1Q96E52 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OMA1Q96E52 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OMA1Q96E52 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OMA1Q96E52 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OMA1Q96E52 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OMA1Q96E52 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
OMA1Q96E52 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OMA1Q96E52 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
OMA1Q96E52 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
OMA1Q96E52 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
OMA1Q96E52 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
OMA1Q96E52 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
OMA1Q96E52 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
OMA1Q96E52 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
OMA1Q96E52 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OMA1Q96E52 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms