Protein–RNA interactions for Protein: Q96A05

ATP6V1E2, V-type proton ATPase subunit E 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E2Q96A05 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6V1E2Q96A05 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms