Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDF6

RASGRP4, RAS guanyl-releasing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRP4Q8TDF6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RASGRP4Q8TDF6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RASGRP4Q8TDF6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RASGRP4Q8TDF6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RASGRP4Q8TDF6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RASGRP4Q8TDF6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RASGRP4Q8TDF6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RASGRP4Q8TDF6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RASGRP4Q8TDF6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RASGRP4Q8TDF6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms