Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RYBPQ8N488 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RYBPQ8N488 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms