Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLNKQ7Z7G1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms