Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUX4L9Q6RFH8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms