Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMEM164Q5U3C3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM164Q5U3C3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms