Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCGF3Q3KNV8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCGF3Q3KNV8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCGF3Q3KNV8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCGF3Q3KNV8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCGF3Q3KNV8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCGF3Q3KNV8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCGF3Q3KNV8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCGF3Q3KNV8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCGF3Q3KNV8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCGF3Q3KNV8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCGF3Q3KNV8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCGF3Q3KNV8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PCGF3Q3KNV8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCGF3Q3KNV8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PCGF3Q3KNV8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCGF3Q3KNV8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCGF3Q3KNV8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCGF3Q3KNV8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCGF3Q3KNV8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCGF3Q3KNV8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCGF3Q3KNV8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCGF3Q3KNV8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCGF3Q3KNV8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCGF3Q3KNV8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCGF3Q3KNV8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCGF3Q3KNV8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCGF3Q3KNV8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCGF3Q3KNV8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCGF3Q3KNV8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCGF3Q3KNV8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms