Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HERC3Q15034 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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