Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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