Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms