Protein–RNA interactions for Protein: Q07011

TNFRSF9, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF9Q07011 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFRSF9Q07011 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms