Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms