Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCNA1P78396 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNA1P78396 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNA1P78396 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNA1P78396 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNA1P78396 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNA1P78396 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNA1P78396 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNA1P78396 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNA1P78396 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNA1P78396 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNA1P78396 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNA1P78396 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNA1P78396 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNA1P78396 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNA1P78396 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms